하버드 소속 포닥이 알려주는 실험 논문 해석집

1. 논문해석 이것만 알면 반은 먹고들어간다 …………………………… p5

2. 첫번째 실험사전 : 유전자 발현량 확인 …………………………………… p9
a. Reverse transcription quantitative polymerase chain reaction (RT-qPCR) …p10
b. Western blot (WB) ………………………………………………………………………p13
c. Reporter assay (promoter assay) …………………………………………………p15
d. Chromatin immunoprecipitation assay (ChIP assay) ……………………… p18

3. 두번째 실험사전 : 단백질의 상호작용 (interaction) 확인……………… p21
a. Immunoprecipitation (IP, 면역침강법) ……………………………………………p22
b. Pull down assay (GST, His-tag) …………………………………………………… p27
c. Isothermal titration calorimetry (ITC) …………………………………………… p30
d. Proximity ligation assay (PLA) ………………………………………………………p33

4. 세번째 실험사전 : Genome wide data의 해석 ………………………… p35
a. Microarray ………………………………………………………………………………… p36
b. RNA sequencing (RNA-seq) ………………………………………………………… p39
c. Tissue microarray (TMA) ………………………………………………………………p44
d. Gene set enrichment assay (GSEA) ………………………………………………p46
e. ChIP sequencing (ChIP-seq) …………………………………………………………p48

5. 네번째 실험사전 : Genome editing …………………………………… p50
a. Zinc-finger nuclease (ZNF) ………………………………………………………… p51
b. Transcription activator-like effector nucleases (Talen) ………………… p53
c. CRISPR/Cas9 system …………………………………………………………………… p54
d. Cre-loxP system ………………………………………………………………………… p59

6. 글을 마치며 …………………………………………………………………… p63
7. Reference …………………………………………………………………… p64

#필자소개

중앙대학교 학사, 석박사 통합과정 (분자생물학 박사 학위 취득)

현재 Harvard Medical School/Boston Children"s Hospital Resach Fellow

- 19편의 SCI, SCIE 급 논문에 주저자, 공동저자로 참여

- Impact factor 10점 이상의 SCI급 논문 게재 (NAR) (한빛사 홈페이지에도 게재되었습니다)

- 1편의 특허 출원 및 등록

- 한국연구재단 박사후 국외연수 (전략분야 3년형), Reseach Fellow 포함 3건의 연구비 수주 (1년 연구비 4500만원, 연구기간 3년, 총액 1억 3500만원 / 1년 연구비 5천만원, 연구기간 2년, 총액 1억 / 연구기간 1년, 1천만원)

#이런 분들에게 추천 드립니다.

생명과학 분야로 진학할 예정이신 분들, 생명과학 재학생들

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#책 내용 (20.10.10 업데이트 - 66 page)

책 내용은 간단한 실험 원리 / 예시를 통한 논문 해석법 / 쉽게 설명하기로 구성되어 있습니다.

읽고 나시면 대부분의 논문들의 구성은 파악하실 수 있을 것이며 기본적인 분자생물학 실험에 대한 이해와 해석이 가능할 것이라 생각됩니다.

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